• 1982-1985 :        Assistant à l'Institut de Papyrologie, Université de Leyde
• 1989-1991 :        Archéologue contractuel (AFAN): responsable de secteur ou chargé d'étude sur des chantiers à Arles et à Nîmes
• 1991-1999 :        Chargé de mission à l'Institut de Recherche sur la Provence Antique (Musée de l'Arles Antique)
• 1999-2002 :       Attaché de conservation contractuel au Musée de l'Arles Antique; responsable du service archéologique
• 2002-2008 :       Ingénieur de recherche au CNRS, affecté au Centre Lenain de Tillemont (CNRS – Université Paris IV-Sorbonne)
• Depuis 2009 :     Affecté à l’UMR 7299, Centre Camille Jullian (AMU –  CNRS)
• 2018 :               Nommé directeur de recherche.

Ses thèmes de recherche sont :

• Évolution de la topographie urbaine de la ville d'Arles durant l’Antiquité. L'ensemble de ces études doivent déboucher sur un fascicule de l'Atlas Topographique des Villes de Gaule Narbonnaise.
• Fouille et étude du groupe épiscopal d’Arles (enclos Saint-Césaire).
• Recherches plus générales sur l'évolution topographique des villes en Occident méridional entre l'Antiquité et le Moyen-Age, en particulier en Provence.
• Étude et publication de la collection épigraphique de la ville d'Arles; participation aux projets ILN (Inscriptions Latines de Narbonnaise) et RICG(Recueil des Inscriptions Chrétiennes de la Gaule).

Bibliographie

• J. Guyon, M. Heijmans (dir.), D’un monde à l’autre. Naissance d’une Chrétienté en Provence. IV^e – VI^e siècle, catalogue d'exposition, Arles 2001.
• M. Heijmans, Arles durant l’Antiquité tardive. De la Duplex Arelas à l’Urbs Genesii (Col. EFR, 324), Rome, EFR, 2004.
• M. Heijmans, J. Guyon (dir.), dossier « Antiquité tardive, haut Moyen Âge et premiers temps chrétiens en Gaule méridionale, 1^ère partie : réseau des villes, monde urbain et monde des morts », Gallia, 63, 2006, p. 1-170.
• Heijmans, J.-M. Rouquette, Cl. Sintès, Arles antique, Guides archéologiques de la France, 41, Paris 2006.
• M. Heijmans, J. Guyon (dir.), dossier « Antiquité tardive, haut Moyen Âge et premiers temps chrétiens en Gaule méridionale, 2^ère partie : « monde rural, échanges et consommation » Gallia, 64, 2007, p. 1-189.
• M. Heijmans, direction scientifique du chapitre « L’antiquité fondatrice » (collaborateurs : P. Arcelin, M. Christol, Ph. Leveau, P. Gros, J. Guyon), in : J.-M. Rouquette (dir.), Arles, des origines à nos jours. Histoire, territoires, cultures, Paris, Imprimerie nationale, 2008, p. 103-269.
• M.-P. Rothé, M. Heijmans (dir.), Carte Archéologique de la Gaule, 13/5, Arles, Camargue, Crau, Paris 2008.
• M.-J. Delage, M. Heijmans, Vie de Césaire d’Arles (Sources Chrétiennes, 536), Paris, Le Cerf, 2010.
• Y. Codou, L. Heijmans (dir.), Histoire et archéologie de la Provence antique et médiévale. Hommages à Jean Guyon, Prov. Hist., 243-244, janv.-juin 2011.
• J. Guyon, M. Heijmans (dir.), L’Antiquité tardive en Provence (IV^e-VI^e siècle), Naissance d’une chrétienté, Arles, Actes Sud, 2013.
• Pietri, M. Heijmans, Prosopographie Chrétienne du Bas-Empire, 4, La Gaule Chrétienne (314-614), Paris, 2013.
• P.-A. Jacob, P. Boulhol, Ph. Borgard, J. Guyon, M. Heijmans, Maxime de Riez entre l'histoire et la légende, Riez 2014.
• M. Heijmans (dir.), L’Académie d’Arles. Splendeurs et renaissances, Paris, Buchet et Chastel, 2016.
• M. Heijmans, A. Ozoline (éd.), Autour des reliques de saint Césaire d’Arles. Actes du colloque d’Arles des 11, 12 et 13 octobre 2013, Arles, AST, 2018.
• D. Djaoui, M. Heijmans (dir.), Archéologie et histoire en territoire arlésien, Mélanges offerts à Jean Piton, Autun, Mergoil, 2019.
• M. Heijmans (éd.) Concile d’Arles. Première assemblée des évêques de  l’Église naissante d’Occident, 314-2014. Actes du colloque du 11 octobre 2014, Arles, Académie d’Arles, 2020.